Yoon es el primer presidente sentado de Corea del Sur en enfrentar un arresto.
Los investigadores tienen hasta el 6 de enero para ejecutar la orden y pueden solicitar una extensión.
Sin embargo, no está claro si los investigadores podrán ejecutar la orden, ya que pueden ser frustrados por su equipo de seguridad y los manifestantes.
El servicio de seguridad presidencial bloqueó anteriormente a los investigadores para ingresar a los terrenos de la oficina presidencial y la residencia privada de Yoon para realizar búsquedas aprobadas por la corte.
En el pasado, las autoridades de Corea del Sur han renunciado a intentos de arresto contra políticos prominentes después de que sus ayudantes y partidarios han bloqueado físicamente a la policía.
El lunes, el equipo legal de Yoon dijo que los investigadores no tenían autoridad para arrestarlo, ya que declarar la ley marcial estaba dentro de la autoridad constitucional del presidente.
Yoon había defendido anteriormente su decisión de declarar la ley marcial y había jurado “luchar hasta el final”, aunque también dijo que no eludiría sus responsabilidades legales y políticas.
Su abogado, Yun Gap-geun, dijo que la falta de Yoon al cumplir con las tres citaciones anteriores se debió a “preocupaciones legítimas”.
No se conoce públicamente el paradero de Yoon, pero se le ha prohibido salir del país.
Aunque ha sido suspendido de sus funciones presidenciales desde el 14 de diciembre después de que los legisladores votaran para destituirlo, solo puede ser destituido de su cargo si su destitución es confirmada por la corte constitucional del país.
Actualmente solo hay seis jueces en la banca de nueve miembros de la corte constitucional. Esto significa que un solo rechazo salvaría a Yoon de ser destituido.
Los legisladores de la oposición esperaban que la nominación de tres jueces adicionales mejorara las posibilidades de que Yoon fuera destituido, pero su propuesta fue vetada por el primer ministro Han Duck-soo la semana pasada.
Desde entonces, la oposición votó para destituir a Han, quien había asumido como líder interino después de que Yoon fuera suspendido.
Ahora, están amenazando con hacer lo mismo con el ministro de finanzas Choi Sang-mok, quien actualmente se desempeña como presidente interino y primer ministro interino.
Reportaje adicional de Kelly Ng